Operationer i mave-, tarm- og bugspytkirtelområdet vil kunne medfører utilstrækkelig tilstedeværelse af enzymer i tarmen sammen med maden. Derved opstår EPI.
For eksempel vil en delvis eller fuldstændig fjernelse af bugspytkirtlen medføre nedsat eller ingen enzymproduktion.
Flere forskellige indgreb, hvor man forbinder organerne med hinanden på en ny måde, vil kunne betyde, at maden og enzymerne ikke længere mødes, og maden bliver således ikke spaltet i smådele. Enten frisættes enzymerne fra bugspytkirtlen før maden er til stede i tarmen eller også er maden passeret forbi, når enzymerne dukker op. Denne tilstand behandles med tilskud af enzymer.