Kronisk betændelse i bugspytkirtlen er den hyppigste årsag til EPI. Det er ikke en bakterieudløst betændelse, men kirtelvævet fungerer dårligere, således at fordøjelsen bliver påvirket. Kronisk betændelse i bugspytkirtlen hedder også kronisk pancreatitis og er en livsvarig arvævsdannelse i bugspytkirtlen, som kan give mavesmerter, vægttab, diarré og fedtet afføring. Arvævsdannelsen kan resultere i, at en større del af bugspytkirtlens enzymproducerende væv går til grunde.
Hvis bugspytkirtlen ikke producerer tilstrækkeligt med enzymer, kan især fedtet i kosten ikke fordøjes. Det gør afføringen tynd og fedtet. Den fedtede afføring (steatoré = fedtdiaré) kan være vanskelig at skylle ud af toilettet, og den kan afgive en meget ubehagelig lugt. Desuden vil man komme til at mangle vigtige næringsoffer og visse vitaminer.
Den insulin-producerende del af bugspytkirtlen kan også blive ødelagt, og der udvikles sukkersyge.
De hyppigste årsager til kronisk pancreatitis:
Ved betændelse i bugspytkirtlen er det bedst, at indtagelse af alkohol ophører og rygning indstilles.